リンガフランカ（翻訳会社）の伊藤です。

You’re so bueatiful.

↓

×　You’re just joking.  /  Not really.

〇　Thank you.

You’re are a good cook.

↓

×　Not really.

〇　Thank you for the complement.

日本語なら、「いいえ、そんなことは・・・」という答えでもよいのですが、英語でそれを言うとかえって失礼になります。

英語を話すときは、日本語で言うであろうことを直訳して話すのはNGですね (^_-)-☆